home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00159 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  25 lines
  1. **********************************************
  2. * Eukaryotic DNA topoisomerase I active site *
  3. **********************************************
  4.  
  5. DNA topoisomerase I (EC 5.99.1.2) [1,2] is one of the two types of enzyme that
  6. catalyze the interconversion of topological DNA isomers. Type I topoisomerases
  7. act by  catalyzing  the  transient  breakage of DNA, one strand at a time, and
  8. the subsequent  rejoining  of  the  strands. When a topoisomerase breaks a DNA
  9. backbone bond,  it  simultaneously forms a protein-DNA link where the hydroxyl
  10. group of a tyrosine residue is joined to a 3'-phosphate  on DNA, at one end of
  11. the enzyme-severed  DNA  strand. In eukaryotic and poxvirus  topoisomerases I,
  12. there are  a number of conserved residues in the region around the active site
  13. tyrosine.
  14.  
  15. -Consensus pattern: [DE]-x(6)-[GS]-x-S-K-x(2)-Y-[LIVM]-x(3)-[LIVM]
  16.                     [Y is the active site tyrosine]
  17. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  19. -Last update: May 1991 / Pattern and text revised.
  20.  
  21. [ 1] Sternglanz R.
  22.      Curr. Opin. Cell Biol. 1:533-535(1990).
  23. [ 2] Lynn R.M., Bjornsti M.-A., Caron P.R., Wang J.C.
  24.      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86:3559-3563(1989).
  25.